重庆大学，教育部直属，中央直管的副部级大学，、、双一流高校。重庆大学创办于年，今天的重庆大学由原重庆大学、重庆建筑大学、重庆建筑高等专科学校合并而成。重庆大学是以工科学科为优势学科的综合性大学，以机械工程、仪器科学与技术、电气工程、计算机科学与技术、土木工程、建筑学、法学等为特色学科，其中机械工程、土木工程、电气工程为双一流学科，有3个A类学科，29个B类学科。
西南大学，教育部直属，高校。西南大学由原西南师范大学和西南农业大学合并而成，是教育部直属的6所师范类高校。西南大学以生物学为一流建设学科，其中马克思主义理论、教育学、心理学被评为A-,有20个B类学科，14个C类学科。西南大学是西南地区最好的师范类高校，但是合并后实力并没有增强，在学科上不如东北师大和华中师大，也不如省属南京师大和华南师大，农林类学科实力也没有提升。
西南政法大学，简称西政，教育部与重庆市共建高校。西政是新中国最早建立的高等政法学府，有政法界的黄埔军校的美誉，是全国培养法治人才最多的高校。西政因历史因素错过了高校、双一流高校，在当年毅然拒绝与重庆大学合并，错过了发展的最好机遇。西政的法学学科被评为A,是重庆高校学科最高评级，有8个C类学科，整体实力在下降，与中国政法大学的差距在拉大，与华政、中南政法相比也没什么优势。
重庆医科大学，教育部、卫计委和重庆市共建高校。重庆医科大学创办于年，是原上海第一医学院分迁组建而成，以临床医学、医学检验、药学、护理学为特色学科，其中临床医学被评为B+，基础医学、药学、护理学B-，口腔医学C+,公共卫生与预防医学C。重庆医科大学学科实力挺强的，在独立办学的医学类高校中仅次于首都医科大学、南京医科大学、哈尔滨医科大学、第二军医大学、第四军医大学；其临床医学实力高过高校中的天津医科大学、郑州大学、苏州大学。医院重庆医院、医院、医院分医院中排名56、58、98，整体实力还是不错的。
重庆邮电大学，简称重邮，工信部与重庆市共建高校。重邮创办于年，重庆与北邮、南邮、西邮、成电、西电、杭电、桂电并称四邮四电，综合实力位居第五。重庆邮电大学的王牌专业计算机科学与技术、信息与通信工程被评为B+，软件工程、控制科学与工程为B-，电子科学与技术为C+,在信息科技领域学科实力并不输于重庆大学，性价比很高。